近年来，猪场疾病发作越来越频繁和复杂，相应的疾病防控手段相对落后。许多猪场在使用常规免疫措施失败后，采取了特殊的免疫措施。而自制苗的使用，尤其是2002年圆环病毒肆虐的时候，一些无奈试种的养猪场带头试种自己种苗，结果转了个弯，这直接导致自家种的苗成为部分农民心目中的最后一根救命稻草。
临时效果夸大了自制苗的有效性。事实上，在专家和一些冷静的农民看来，自制苗总是存在着各种弊端和不确定性。是最后一根“救命稻草”。
中国特色自制苗效果不明显
国际上自制疫苗的概念是“自体疫苗”。在欧美国家，一般都是从猪身上提取特殊的病毒和细菌，在实验室进行复杂的培养、纯化、灭活，制成疫苗，然后给猪接种。但是，在中国，这个观念已经发生了翻天覆地的变化。养殖户一般将猪的病变组织简单研磨过滤，加入甲醛、福尔马林等溶液灭活，然后直接注射到猪体内。
广东海大集团阳东猪场负责人黄少斌在操作层面对这种免疫方式提出了质疑。他认为，普通养猪场不具备这样的实验室设备和技术实力，不具备制作有效疫苗的条件，在灭活方面存在问题。由于目前的猪场普遍是混合感染，一种病害饲料中可能存在多种病原体，灭活条件不同，单一病原体的灭活会使其他病原体灭活不彻底，造成人为解毒；同时，在专注力方面也是一个问题。以普通猪场的技术条件，无法确定自家苗中目标灭活物质的具体含量。盲目注射的结果是要么没有效果，要么毒性变大。
广东省养猪业协会秘书长范福豪表示，不建议养猪场使用自家疫苗。他认为，疫苗难以选择合适的病变组织并确定其致病成分，这直接导致其缺乏针对性，往往无济于事。去做，后患无穷。
首先，自制疫苗是在车间手工制备的。病毒和细菌无处不在。即便是实力强大的生物药厂，也有传播病毒的风险，更何况是养猪场的小作坊生产。灭活不彻底。无疑，这种免疫方式将成为病毒人为传播的帮凶。
其次，自制疫苗来源于猪自身组织。根据生物学原理，使用它会导致人体产生自身免疫性疾病；而自制疫苗时添加的福尔马林灭活剂，则是对猪自身免疫系统的又一次伤害。仔猪的来源对仔猪的危害尤其大，养起来会比较困难，长得慢。
缺乏可持续性是暂时的“生死攸关”
在实际应用过程中，自制疫苗的起步阶段效果较好。比如，2007年高致病性蓝耳病爆发期间，惠州一位李姓养猪场负责人告诉记者，当时他的养猪场病得很重。一半的猪开始出现症状，无奈之下，他们自制疫苗，每头猪注射10毫升左右，疫情才得到控制。死了十几头猪后，猪群才稳定下来。不过李主任首战告捷后，这两年的几次使用都没有效果。
黄少斌对此并不意外：“自制苗是临时应急措施，不可持续。使用一段时间后，病材典型性变差，所产苗效果较弱。” “
事实上，当一个猪场已经用自己的疫苗进行免疫后，随着疾病的发展，往往原来典型的病害材料变得不再典型，或者在免疫压力下致病谱发生变化，这时就会出现制备困难的情况。自己的疫苗。效果大打折扣，甚至出现“低剂量病毒感染引发群体免疫耐受”的现象。同时，反复使用含有大量非自身蛋白抗原的自制疫苗，会使猪处于强烈的免疫应激状态，一般表现为多发淋巴结，从而降低猪的抗病能力。为了抵抗其他病原体和环境变化，皮肤病、副猪嗜血杆菌、链球菌和腹泻等问题随之而来。这些现象说明，自制苗是不可持续的，在生猪情况失控时，它们只是压垮养殖户的最后一根稻草。
专家提醒慎用或易散毒
袁世山，博士。中国农科院主管，曾在接受农财宝店记者采访时表示疑惑：他认为我国部分地区PRRSV的反复防治和加剧，可能与病毒的人为散播有关通过生产和使用本土种苗。
另一位中国农科院专家表示，自制疫苗的原理其实和正规疫苗公司生产的疫苗是一样的。他们使用安全范围内的病原体来刺激动物的免疫系统并获得对特定疾病的抵抗力。会有一定的作用。然而，大多数养猪场在自制疫苗时，在技术、工艺、设备等方面存在缺陷，结果往往弊大于利。猪场在决定是否使用疫苗之前，必须了解使用自家疫苗的风险。
华南农业大学兽医学院张桂红教授也向记者介绍了副猪嗜血杆菌的防控情况，指出即使在自制苗时获得了典型的病害材料，也可能是由于强马戏团和猪瘟等病毒的抵抗力。灭活不彻底，会给后续疫情防控带来困扰。因此，应尽可能使用商业疫苗。
哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室副研究员田志军认为，猪场免疫并没有那么简单。自己制作疫苗不可能搞定所有事情。由于负面影响很大，除非万不得已，不要使用这种极端的方法。 “我们自己的疫苗里面有各种各样的异物，致病成分不明确，针对性不强，所以不一定有效。”他举了一个例子：正规的疫苗生产是用兔子来培育猪瘟乳兔疫苗。原理与自制苗相似，但都是已知菌种的培养，后续的准备也有针对性。但自制苗的组织选择、时机和数量并不固定，显然难以达到预期效果。
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